Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scn1bP97952 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms