Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcmtd1P59913 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmtd1P59913 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms