Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RHBDL3P58872 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL3P58872 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms