Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA2D1P54289 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D1P54289 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms