Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FanccP50652 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FanccP50652 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FanccP50652 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FanccP50652 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FanccP50652 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FanccP50652 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FanccP50652 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FanccP50652 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FanccP50652 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FanccP50652 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FanccP50652 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FanccP50652 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms