Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK8P49336 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK8P49336 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK8P49336 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK8P49336 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK8P49336 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK8P49336 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK8P49336 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms