Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epb42P49222 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epb42P49222 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms