Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl5P47962 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl5P47962 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl5P47962 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms