Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP5P45974 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP5P45974 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP5P45974 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP5P45974 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP5P45974 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP5P45974 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP5P45974 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP5P45974 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP5P45974 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP5P45974 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP5P45974 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP5P45974 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms