Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin1P35438 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin1P35438 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin1P35438 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin1P35438 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms