Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apoc3P33622 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms