Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csn1s1P19228 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csn1s1P19228 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms