Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME1P15531 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME1P15531 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME1P15531 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME1P15531 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME1P15531 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME1P15531 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME1P15531 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME1P15531 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME1P15531 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME1P15531 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME1P15531 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME1P15531 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME1P15531 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME1P15531 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME1P15531 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME1P15531 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms