Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FosbP13346 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FosbP13346 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FosbP13346 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FosbP13346 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FosbP13346 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FosbP13346 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FosbP13346 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FosbP13346 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FosbP13346 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FosbP13346 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FosbP13346 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FosbP13346 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FosbP13346 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms