Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NR2F1P10589 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NR2F1P10589 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms