Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd8bP10300 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd8bP10300 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms