Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFTA3P0C7M3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFTA3P0C7M3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms