Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GJB1P08034 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GJB1P08034 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB1P08034 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB1P08034 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB1P08034 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB1P08034 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB1P08034 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB1P08034 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB1P08034 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB1P08034 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms