Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP9AO75110 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms