Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNT2O60583 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNT2O60583 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNT2O60583 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms