Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-201ENST00000354191 1695 ntTSL 215.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-207ENST00000602804 1804 ntTSL 215□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-208ENST00000630940 1664 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-204ENST00000602276 708 ntTSL 511.67□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-205ENST00000602438 576 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 BORCS8-MEF2B-206ENST00000602689 554 ntTSL 38.16□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.088e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-218ENST00000635859 100 ntTSL 513.22□□□□□ -0.297e-14■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.688e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 59.59□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 28.1
RBFOX2O43251 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 57.63□□□□□ -1.198e-8■■■■■ 28.1
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RBFOX2O43251 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 56.13□□□□□ -1.439e-8■■■■■ 28
RBFOX2O43251 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 28
RBFOX2O43251 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 28
RBFOX2O43251 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28
RBFOX2O43251 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-206ENST00000475200 527 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-201ENST00000370183 655 ntTSL 311.41□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 BTRC-205ENST00000465182 685 ntTSL 35.43□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 28
RBFOX2O43251 GOLGA2-206ENST00000468488 531 ntTSL 39.59□□□□□ -0.875e-14■■■■■ 28
RBFOX2O43251 IARS-207ENST00000467876 298 ntTSL 31.6□□□□□ -2.152e-18■■■■■ 28
RBFOX2O43251 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 28
RBFOX2O43251 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.113e-8■■■■■ 28
RBFOX2O43251 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 28
RBFOX2O43251 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 27.9
RBFOX2O43251 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 27.9
RBFOX2O43251 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 24.42□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 27.9
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RBFOX2O43251 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-8■■■■■ 27.9
RBFOX2O43251 GRK2-202ENST00000416281 4493 ntTSL 211.64□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 27.9
RBFOX2O43251 GRK2-213ENST00000533077 3453 ntTSL 28.95□□□□□ -0.985e-8■■■■■ 27.9
RBFOX2O43251 MST1-205ENST00000480268 648 ntTSL 312.62□□□□□ -0.394e-62■■■■■ 27.9
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RBFOX2O43251 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.659e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 27.8
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RBFOX2O43251 ACOT7-207ENST00000473466 868 ntTSL 511.65□□□□□ -0.549e-7■■■■■ 27.8
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RBFOX2O43251 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 27.8
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RBFOX2O43251 PLEKHG3-205ENST00000490180 4403 ntTSL 211.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 27.8
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RBFOX2O43251 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 211.55□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-221ENST00000488111 2381 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-217ENST00000461350 3299 ntTSL 29.24□□□□□ -0.938e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 59.21□□□□□ -0.948e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 COPS7B-213ENST00000449174 668 ntTSL 38.72□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 EMILIN2-203ENST00000583776 775 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 EMILIN2-202ENST00000308080 1544 ntTSL 516.94■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ZNF765-203ENST00000504235 2059 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ZNF765-208ENST00000596086 595 ntTSL 311.7□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ZNF765-206ENST00000594030 7588 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 ZNF765-207ENST00000594627 526 ntTSL 47.35□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 27.8
RBFOX2O43251 INTS1-204ENST00000482994 498 ntTSL 313.67□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 27.7
RBFOX2O43251 SPATS2L-203ENST00000366118 695 ntTSL 33.3□□□□□ -1.883e-7■■■■■ 27.7
RBFOX2O43251 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 27.7
RBFOX2O43251 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 27.7
RBFOX2O43251 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 27.7
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