Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn34aG3UW52 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms