Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMO7DNF2Z398 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMO7DNF2Z398 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms