Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn2r56E9Q4U5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn2r56E9Q4U5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn2r56E9Q4U5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms