Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcc4E9Q236 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcc4E9Q236 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms