Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rspo1Q9Z132 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rspo1Q9Z132 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms