Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP20Q9Y2K6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms