Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP11BQ9Y2G3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms