Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DENND2AQ9ULE3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND2AQ9ULE3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND2AQ9ULE3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms