Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps29Q9QZ88 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms