Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTTNBP2NLQ9P2B4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTTNBP2NLQ9P2B4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms