Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIS18AQ9NYP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIS18AQ9NYP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms