Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPD4Q9NXE4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPD4Q9NXE4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms