Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI43

Rhox4b, Homeobox protein EHOX, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4bQ9JI43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4bQ9JI43 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhox4bQ9JI43 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms