Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOPCQ9HD26 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOPCQ9HD26 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms