Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABDQ9H4I3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms