Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXF3Q9H4D5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF3Q9H4D5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms