Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cpne8Q9DC53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne8Q9DC53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne8Q9DC53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne8Q9DC53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne8Q9DC53 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne8Q9DC53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms