Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rhobtb3Q9CTN4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhobtb3Q9CTN4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms