Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC8Q9BY41 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms