Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3CQ9BUI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR3CQ9BUI4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms