Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF558Q96NG5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms