Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF488Q96MN9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF488Q96MN9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms