Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q96MF0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q96MF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q96MF0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q96MF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q96MF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q96MF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q96MF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q96MF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms