Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHF21BQ96EK2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms