Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOT1Q8IXI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT1Q8IXI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms