Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR49Q8IV35 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR49Q8IV35 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms