Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCIMPQ6UWF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCIMPQ6UWF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCIMPQ6UWF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCIMPQ6UWF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCIMPQ6UWF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms