Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms