Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
2810408A11RikQ6NSU2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
2810408A11RikQ6NSU2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms